2013年10月3日, 生物信息学领域国际著名期刊Bioinformatics在线发表了以我院本科生孙毫棋同学为第一作者的研究工作，该工作基于统计学习的排序融合算法，开发了开放式的跨平台软件iPEAP (Integrative Pathway Analysis Platform), 首次整合了转录组，代谢组，蛋白质组，GWAS四种类型的高通量数据，用以进行通路富集分析，克服了传统富集分析仅仅依赖于单一组学数据的不足，为下游的生物学功能分析提供了更加准确和客观的指导。同时该软件首次借鉴了Google搜索引擎对于网页排序的定量评价思想，用以对于通路富集排序的定量评价以及可视化比较。通过对于肝癌细胞系在化合物刺激下的转录组--代谢组学联合分析以及德国和英国群体的SNP和代谢组关联分析的两大数据集的测试，iPEAP获得了理想的通路富集分析结果。该工作体现了近年来我院本科生教学及科研水平的进一步提升和发展。

         孙毫棋同学从航力学院转入我院， 大二以来进入曹志伟教授课题组进行学习和科研。课题源于上海市SITP项目“整合多源高通量数据的通路富集分析”，在刘琦副教授的指导下进行研究，历时两年时间完成软件的开发，数据分析及论文的撰写工作。

         该工作得到了上海市SITP项目, 国家自然科学基金以及科技部863项目的经费支持。