教授

薛剑煌

发布时间:2019-05-08  

姓名薛剑煌

学位博士

导师情况博士生导师

研究领域表观遗传学与白血病

E-mail: xuejianhuang@tongji.edu.cn

通讯地址上海市杨浦区四平路1239号道交馆215室,同济大学生命科学与技术学院,邮编200092


个人简介:

20126月毕业于南京大学,获理学学士学位;2019年1月毕业于中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所,获理学博士学位。2021年在美国希望之城国家医学中心完成博士后训练,并于9月起加入同济大学生命科学与技术学院,担任“青年百人计划”特聘研究员,博士生导师;并担任同济大学附属同济医院双聘研究员。薛剑煌博士长期从事DNA/RNA修饰的动态变化机制及其在发育与肿瘤中的生物学功能研究,曾以第一作者(含共同)在Nature、Sci Transl Med、J Biol Chem、Cell Research等杂志发表学术论文,曾获吴瑞奖、中科院优秀博士学位论文等荣誉;入选上海市科技青年35人引领计划、上海市海外高层次人才计划;国自然面上项目、国家重点研发计划、上海市面上项目等支持。

 

研究方向:

1. 新型DNA修饰与修饰酶的发现及其功能与调控机制。

2. DNA修饰在疾病、衰老中的功能与作用机制。


研究内容:

DNA修饰是表观遗传学的重要研究内容,本课题组主要关注由酶促反应催化产生的可遗传的DNA修饰的生物学功能与调控机制。真核生物中已知的DNA修饰种类较少,我们将探索自然界中存在的新型DNA修饰及其修饰酶,解析该修饰产生、去除以及被识别的分子机理,阐述其生物学功能,进一步拓展DNA修饰的研究范围与应用前景。

DNA修饰的动态变化对哺乳动物的生长发育以及衰老等过程具有极其重要的影响,其异常变化将可能诱发多种疾病。其中,白血病的发病过程与DNA修饰的异常变化密切相关,我们将深入解析DNA修饰在白血病中的作用机理,并开发白血病的早期诊断以及靶向疗法。另一方面,DNA的表观遗传时钟与衰老密切相关,我们还将探索不同DNA修饰在衰老中的功能与调控机制,设计更准确的新型DNA表观遗传时钟,为衰老干预提供重要参考。

此外,我们的工作还将涉及部分RNA修饰的研究,将探究mRNA上丰富的表观遗传修饰对白血病与衰老的影响并解析其调控机理。

 

本课题组设备齐全、经费充足;课题组常年招聘博士后和研究生,欢迎博士生、硕士生、本科生报考;欢迎同学们前来参观交流或实习。

 

代表性论文:(*Co-first authors; #Corresponding authors)

1. Xue JH*, Chen GD*, Hao F*, Chen H*, Fang Z, Chen FF, Pang B, Yang QL, Wei X, Fan QQ, Xin C, Zhao J, Deng X, Wang BA, Zhang XJ, Chu Y, Tang H, Yin H, Ma W, Chen L, Ding J, Weinhold E, Kohli RM, Liu W, Zhu ZJ, Huang K#, Tang H#, Xu GL#. A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue Nature 2019 May;569(7757):581-585.

2.  Meng WY*, Wang ZX*, Zhang Y, Hou Y#, Xue JH#. Epigenetic marks or not? The discovery of novel DNA modifications in eukaryotes J Biol Chem. 2024 Feb 23:106791.

3.  Chen Z*, Zhou K*, Xue J*, Small A*, Xiao G, Nguyen LXT, Zhang Z, Prince E, Weng H, Huang H, Zhao Z, Qing Y, Shen C, Li W, Han L, Tan B, Su R, Qin H, Li Y, Wu D, Gu Z, Ngo VN, He X, Chao J, Leung L, Wang K, Dong L, Qin X, Cai Z, Sheng Y, Chen Y, Wu X, Zhang B, Shi Y, Marcucci G, Qian Z, Xu M, Müschen M, Chen J#, Deng X#. Phosphorylation stabilized TET1 acts as an oncoprotein and therapeutic target in B-cell acute lymphoblastic leukemia Sci Transl Med. 2023 Mar 29;15(689):eabq8513.

3. Xue JH*, Xu GF*, Gu TP, Chen GD, Han BB, Xu ZM, Bjørås M, Krokan HE, Xu GL, Du YR#. Uracil-DNA Glycosylase UNG Promotes Tet-mediated DNA Demethylation J Biol Chem. 2016 Jan 8;291(2):731-8.

4. Xue JH*, Xu GF*, Gu TP, Chen GD, Han BB, Xu ZM, Bjørås M, Krokan HE, Xu GL, Du YR#. Uracil-DNA Glycosylase UNG Promotes Tet-mediated DNA Demethylation J Biol Chem. 2016 Jan 8;291(2):731-8.

5. Xue JH, Xu GL#. RNA Pol II as a sensor of 5caC Cell Research 2015 Oct;25(10):1089-90.


6Zhao Z*, Qing Y*, Dong L*, Han L, Wu D, Li Y, Li W, Xue J, Zhou K, Sun M, Tan B, Chen Z, Shen C, Gao L, Small A, Wang K, Leung K, Zhang Z, Qin X, Deng X, Xia Q#, Su R#, Chen J#. QKI shuttles internal m7G-modified transcripts into stress granules and modulates mRNA metabolism Cell 2023 Jul 20;186(15):3208-3226.

7. Li Y, Xue M, Deng X, Dong L, Nguyen LXT, Ren L, Han L, Li C, Xue J, Zhao Z, Li W, Qing Y, Shen C, Tan B, Chen Z, Leung K, Wang K, Swaminathan S, Li L, Wunderlich M, Mulloy JC, Li X, Chen H, Zhang B, Horne D, Rosen ST, Marcucci G, Xu M, Li Z, Wei M, Tian J, Shen B, Su R, Chen J. TET2-mediated mRNA demethylation regulates leukemia stem cell homing and self-renewal Cell Stem Cell 2023 Aug 3;30(8):1072-1090.

8. Han L*, Dong L*, Leung K*, Zhao Z, Li Y, Gao L, Chen Z, Xue J, Qing Y, Li W, Pokharel SP, Gao M, Chen M, Shen C, Tan B, Small A, Wang K, Zhang Z, Qin X, Yang L, Wunderlich M, Zhang B, Mulloy JC, Marcucci G, Chen CW, Wei M#, Su R#, Chen J#, Deng X#. METTL16 drives leukemogenesis and leukemia stem cell self-renewal by reprogramming BCAA metabolism Cell Stem Cell. 2023 Jan 5;30(1):52-68.

9. Su R*, Dong L*, Li Y*, Gao M*, He PC*, Liu W*, Wei J, Zhao Z, Gao L, Han L, Deng X, Li C, Prince E, Tan B, Qing Y, Qin X, Shen C, Xue M, Zhou K, Chen Z, Xue J, Li W, Qin H, Wu X, Sun M, Nam Y, Chen CW, Huang W, Horne D, Rosen ST, He C#, Chen J#. METTL16 exerts an m6A-independent function to facilitate translation and tumorigenesis Nat Cell Biol. 2022 Feb;24(2):205-216.

10. Dou X*, Boyd-Kirkup JD*, McDermott J*, Zhang X*, Li F, Rong B, Zhang R, Miao B, Chen P, Cheng H, Xue J, Bennett D, Wong J, Lan F, Han JJ#. The strand-biased mitochondrial DNA methylome and its regulation by DNMT3A Genome Res. 2019 Oct;29(10):1622-1634.

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