姓名：徐从玲

学位：博士

导师情况：博士生导师 
研究领域：疾病及发育过程中的转录调控机制研究

Email：Conglingxu@tongji.edu.cn
通讯地址：上海市杨浦区四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院

研究方向：

1. 高等生物生理状态下的转录机器调控机制研究

2. 哺乳动物早期胚胎发育过程中的转录调控机制研究

个人简介：

徐从玲，特聘研究员，博士生导师。2018年7月毕业于上海交通大学医学院，获理学博士学位。2018年7月进入复旦大学附属肿瘤医院从事博士后研究。2023年10月以“百人计划”特聘研究员受聘于同济大学生命科学与技术学院，上海市第四人民医院双聘教授。主持多个国家级项目，获得2024年国家自然科学基金委“优秀青年科学基金”，国自然青年项目等。获得上海市“科技启明星”，复旦大学“超级”博士后，第二届中国生物物理学会女科学家论坛-杰出奖等奖项。以通讯/第一（含共同）在Nature,  Science,  Molecular Cell， Science Bulletin等期刊发表论文。

研究方向：  

1. 高等生物生理状态下的转录机器介导的转录调控机制研究

真核生物中，RNA聚合酶II驱动的转录过程是中心法则的核心步骤，对基因表达水平具有决定性的作用。课题组前期工作在国际上首次发现转录早期终止的核心调控复合物INTAC（Science, 2020），并借一步解析了其调控机制。揭示单链DNA结合复合物SOSS与转录早期调控复合物INTAC稳定结合通过调控细胞内R-loop (DNA:RNA hybrid)的水平维持细胞内基因组稳定性（Nature, 2023）。揭示转录机器调控因子SPT5可以维持转录机器的蛋白稳定性，调控转录循环，维持增强子活性（Molecular Cell, 2021）。以上成果获Nature Structure & Molecular Biology，Nature Reviews Molecular Cell Biology，Cancer Discovery, Molecular Cell, Science Bulletin，F1000等专文评述。

2. 哺乳动物早期胚胎发育中的转录调控机制研究

哺乳动物胚胎发育起始于一系列严格调控的细胞命运决定事件，最终形成囊胚中的内细胞团和滋养外胚胎层。滋养外胚层是胎盘发生的基础，而内细胞团则会进一步分化为原始内胚层和外胚层，这两者是构成所有体细胞的前身。这其中，谱系特化的实现依赖于基因表达精准的时空特异性调控，而染色质状态的动态变化和转录调控复合物的协同作用，是驱动谱系特化过程的核心机制。因此，课题组致力于阐明早期胚胎发育过程中，转录调控复合物如何与转录因子以及染色质状态协同调控谱系特化。

本课题组常年招聘博士后，博士生及科研助理，也欢迎博士生，硕士生和本科生联系报考和毕设实习。

已发表文章：#共同第一作者；*共同通讯作者

1.Xu C*^#, Zhou QX^#, Zheng H^#, Song A^#, Zhao WY, Xiong Y, Huang Z, Xu Y*, Cheng J*, Chen FX*. Stabilization of Integrator/INTAC by the small but versatile DSS1 protein. bioRxiv. 2024. (https://doi.org/10.1101/2024.02.25.581915)

2. Shang XY^#, Xu C*, Chen FX*. From snapshots to a movie: Capturing eukaryotic transcription initiation at single-nucleotide resolution. Science Bulletin. 2024 Jan 23: S2095-9273(24)00057-4.

3. Fan P^#, Shang XY^#, Song A^#, Chen S^#, Mao RY, Chen J, Wang Z, Zheng H, Tao B, Xu W, Jiang W, Yang H, Xu C, Zhang P*, Jiang H*, Chen FX*. Catalytic-independent functions of INTAC in conferring sensitivity to BET inhibition. bioRxiv. 2024.

4. Wang J, Xu C, Zhang Z*, Chen FX*. Mechanisms of SOSS-Integrator-PP2A complex in attenuating R-loops and promoting genome stability. Clinical and Translational Medicine. 2024 Jan;14(1): e1519.

5. Xu C^#, Li C^#, Chen J^#, Xiong Y^#, Qiao Z, Fan P, Li C, Ma S, Liu J, Song A, Tao B, Xu T, Xu W, Chi Y, Xue J, Wang P, Ye D, Gu H, Zhang P, Wang Q, Xiao R, Cheng J, Zheng H, Yu X, Zhang Z, Wu J, Liang K, Liu YJ, Lu H*, Chen FX*. R-loop-dependent promoter-proximal termination ensures genome stability. Nature. 2023 Aug 9. doi:10.1038/s41586-023-06515-5.

· Spotlight: SOSS-INTAC: a new gatekeeper of genomic integrity at the interface of transcription and R-loops. Molecular Cell. DOI: 10.1016/j.molcel.2023.09.030.

· Research Watch: SOSS–INTAC Regulates R-loop Accumulation and Genome Stability. Cancer Discovery. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-RW2023-129.

·Research Highlight: Integrator integrates transcription surveillance and genomic integrity. Science Bulletin. https://doi.org/10.1016/j.scib.2023.10.022.

6. Hu S^#, Peng L^#, Xu C^#, Wang Z, Song A, and Chen FX. SPT5 stabilizes RNA polymerase II, orchestrates transcription cycles, and maintains the enhancer landscape.  Molecular Cell. 2021 Nov 4;81(21):4425-4439.e6. 

· News & Views: SPT5 roles in transcriptional elongation. Nature Structural & Molecular Biology. 28, page778 (2021).

7. Zheng H^#, Qi Y^#, Hu S^#, Cao X^#, Xu C^#, Yin Z, Chen X, Li Y, Liu W, Li J, Wang J, Wei G, Liang K, Chen FX*, Xu Y*. Identification of Integrator-PP2A complex (INTAC), an RNA polymerase II phosphatase. Science. 2020 Nov 27;370(6520): eabb5872. 

· Research Highlight: Integrator of PP2A and transcription. Nature Reviews Molecular Cell Biology.  22, pages72–73 (2021)

Before 2020

8. Xu C^#, Wang X^#, Zhou Y, et al. Synergy between arsenic trioxide and JQ1 on autophagy in pancreatic cancer. Oncogene.2019;38(47):7249-7265.

9. Li K^#, Xu C^#, Du Y^#, Junaid M, Kaushik AC, Wei DQ*. Comprehensive epigenetic analyses reveal master regulators driving lung metastasis of breast cancer. J Cell Mol Med. 2019;23(8):54155431.

10. Wang X^#, Fan H, Xu C, et al. KDM3B suppresses APL progression by restricting chromatin accessibility and facilitating the ATRA-mediated degradation of PML/RARα. Cancer Cell Int. 2019;19:256.

11. Jiang G^#, Wang X^#, Sheng D, Zhou L, Liu Y, Xu C, et al. Cooperativity of co-factor NR2F2 with Pioneer Factors GATA3, FOXA1 in promoting ERα function. Theranostics. 2019;9(22):6501-6516.

12. Li S^#, Liu X^#, Zhou Y, Acharya A, Savkovic V, Xu C, et al. Shared genetic and epigenetic mechanisms between chronic periodontitis and oral squamous cell carcinoma. Oral Oncol. 2018; 86:216-224.