姓名：傅沙镠

学位：博士

研究领域：生物信息学、人工智能生物学

导师情况：博士生导师

Email: 26118@tongji.edu.cn

通讯地址：上海市四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院（200092）

实验室主页：https://delta.tongji.edu.cn/

个人简介：

傅沙镠，博士生导师，现任同济大学生命科学与技术学院副教授。2013年于南京农业大学获得理学学士学位；2018年于同济大学获理学硕士学位；2023年于同济大学获理学博士学位；2023-2026年于同济大学生物医学工程博士后流动站从事博士后研究工作。2026年任同济大学生命科学与技术学院预聘副教授。目前已发表SCI论文18篇，其中以第一或共同第一作者署名的SCI论文7篇，参与编写专著1项，担任Nature Methods等期刊审稿人。先后主持国自然科学基金青年（C类），博士后科学基金面上项目和国家资助博士后研究人员计划。

研究方向：

多组学平台开发和转录调控算法开发。

主持或参加科研项目：

1. 青年科学基金项目（主持），构建单细胞多组学生成模型研究转录调控动态机制，项目编号：32400521

2. 博士后面上项目（主持），单细胞多组学整合算法的基准与应用研究，项目编号：2023M742651

3. 国家资助博士后研究人员计划（主持），项目编号：GZC20231946

4. 国家自然科学基金委员会专项项目（参与），基于解耦表征的虚拟细胞“世界模型”构建及应用, 项目编号：32550745

5. 国家自然科学基金面上项目（参与），住区空间要素对环境微生物健康效应的影响：作用机理研究和更新规划评估, 项目编号：52478067

代表论文：

# 共同第一作者

       1. Fu S#, Wang S#, Si D, Li G, Gao Y, Liu Q*, Benchmarking single-cell multi-modal data integrations. Nature Methods. 2025.

2. Li G#, Fu S#, Wang S, Zhu C, Duan B, Tang C, Chen X, Chuai G, Wang P, Liu Q*, A deep generative model for multi-view profiling of single-cell RNA- seq and ATAC-seq data, Genome Biology. 2022.

3. Fu S#, Wang Q#, Moore JE, Purcaro MJ, Pratt HE, Fan K, Gu C, Jiang C, Zhu R, Kundaje A, Lu A, Weng Z#, Differential analysis of chromatin accessibility and histone modifications for predicting mouse developmental enhancers, Nucleic Acids Research. 2018.

4. Tang C#, Fu S#, Jin X, Li W, Xing F, Duan B, Cheng X, Chen X, Wang S, Zhu C, Li G, Chuai G, He Y, Wang P, Liu Q*, Personalized tumor combination therapy optimization using the single-cell transcriptome, Genome Medicine. 2023.

5. Ding T#, Fu S#, Zhang X#, Yang F, Zhang J, Xu H, Yang J, Chen C, Shi Y, Bai Y, Li W, Chang X, Wang S, Zhang C, Liu Q*, Zhang H#, Inter3D: Capture of TAD reorganization endows variant patterns of gene transcription. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2024.

6. Zhao H#, Fu S#, Yu Y, Zhang Z, Li P, Ma Q, Jia W, Ning K, Qu S, Liu Q*. MetaMed: Linking Microbiota Functions with Medicine Therapeutics. Msystems. 2018.

7. Sun F#, Li H#, Sun D#, Fu S#, Gu L#, Shao X#, Wang Q#, Dong X#, Duan B#, Xing F, Wu J, Xiao M, Zhao F, Han J-DJ, Liu Q, Fan X, Li C, Wang C, Shi T. Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications. Science China Life Sciences. 2025.