姓名：沈仕君

学位：博士

导师情况：硕士生导师

研究领域：生物信息学、表观遗传组学、时空组学、发育生物学

E-mail: 22310176@tongji.edu.cn

联系电话：13795384821（微信同号）

实验室主页：https://wukong.tongji.edu.cn/      

通讯地址：同济大学，生命科学与技术学院，医学楼1001，上海市杨浦区四平路1239号，邮编：200092

教育及工作经历：

2026年3月至今，同济大学附属妇产科医院，副研究员

2025年8月至2026年3月，同济大学附属妇产科医院，助理研究员

2022年8月至2025年8月，同济大学，博士后流动站，博士后研究员

2016年9月至2022年7月，同济大学，理学博士，生物学

2012年9月至2016年7月，同济大学，工学学士，生物信息学

研究方向：

1、胚胎及生殖发育中的表观遗传调控机制、表型关联与器官微环境研究

2、细胞命运决定与转变中的表观遗传调控机制、表型关联与微环境研究

3、时空组学分析应用与算法开发

招生专业：

1、生物信息与人工智能

2、发育、衰老与疾病

3、遗传与表观遗传学

个人简介：

沈仕君，博士，副研究员，民建同济大学委员会一支部副主委。长期聚焦细胞命运决定中的染色质重塑及其表观遗传调控机制。以生殖发育为核心，通过发展生物信息学分析方法，结合微量组学、单细胞及空间多组学、基因编辑与临床队列，重点解析了生理及病理状态下，人和小鼠胚胎及器官(如性腺)发育过程中，转录因子调控、染色质开放、组蛋白修饰、DNA甲基化等重要表观景观重塑模式及其调控细胞命运决定的分子机制。近期，尝试利用最新时空组学技术，结合人工智能，开展了一系列图谱绘制与机制解析工作。

相关研究成果以第一作者（含并列）或通讯作者（含共同）发表在Cell Research、Cell Reports Medicine、Nucleic Acids Research、EMBO Journal等国际知名学术期刊；主持国家自然科学基金青年项目，主持中国博士后科学基金面上项目，主持上海市人才计划（启明星-扬帆）等；担任Advanced系列期刊Advanced Genetic副编委、Nature系列期刊Nature communication审稿人等学术职务；荣获上海生物信息学会2025年度学术年会最佳口头报告奖一等奖、中国遗传学会2025年度表观遗传与染色质生物学大会特邀报告、复旦生命科学国际暑期学校学生学术研讨会优秀海报奖一等奖等荣誉；曾获同济大学优秀毕业生（博士）、同济大学优秀博士论文、博士研究生奖学金等荣誉奖励。

代表性文章（Selected Publications，* 并列第一，#共同通讯）：

1. Shen S*, Wang M*, Li X*, Wang B*, Hong W*, Li W, Xu B, Guo Z, Han R, Yi S, Wu Z, He X, Wang L, Zhu Q, Yang G, Wang H, Deng Q, Chen J#, Gao S#, Jiang C#, Gao R#. The gonadal niche safeguards human fetal germline cell development following maternal SARS-CoV-2 infection. Cell Reports Medicine, 2024, 5(5): 101515

说明：本研究揭示了孕早期母源性急性冠状病毒感染对胚胎生殖细胞发育的影响。发现胎儿可感知外界（母体）恶劣环境，揭示胎儿性腺通过预先建立免疫抵抗，进而维护生殖细胞正常发育的关键机制。

2. Li J*, Shen S*, Chen J*, Liu W, Li X, Zhu Q, Wang B, Chen X, Wu L, Wang M, Gu L, Wang H, Yin J, Jiang C#, Gao S#. (2018) Accurate annotation of accessible chromatin in mouse and human primordial germ cells. Cell Research , 2018, 28(11): 1077-1089

说明：本研究利用最新优化的low-input DNase-seq技术结合生物信息学大数据分析，精确注释了原始生殖细胞（PGC）发育过程中染色质的开放状态，为PGC发育过程中各个重要生物学事件提供了重要线索。发现利用染色质开放富集区域可精准预测雌性PGC的同源重组热点并解析其进化特征，揭示原始生殖细胞发育过程中的关键基因及其表观遗传调控机制。

3. Shang X*, Shen S*#, Tang J*, He X, Zhao Y, Wang C, He X, Guo G, Liu M, Wang L, Zhu Q, Yang G, Jiang C, Zhang M, Yu X, Han J, Culleton R, Jiang L, Cao J#, Gu L#, Zhang Q# (2021) A cascade of transcriptional repression determines sexual commitment and development in Plasmodium falciparum. Nucleic Acids Research, 2021, 49(16): 9264-9279

说明：本研究揭示抑制型转录因子AP2-G5通过改变局部表观遗传环境，逐级关闭已完成功能的基因，从而有序控制配子正常发育进程的复杂机制。引用50+，high light in F1000。

4. She X*, Shen S*, Chen G*, Gao Y*, Ma J, Gao Y, Liu Y, Gao G, Zhao Y, Wang C, Jiang C#, Wang P#, Qin H#, Gao H# (2023) Immune surveillance of brain metastatic cancer cells is mediated by IFITM1. EMBO Journal, 2023, 42(7): e111112

说明：本研究发现通过改变转录因子调控可干扰跨膜蛋白IFITM1稳定性，从而影响肿瘤细胞命运与免疫微环境的新机制。

5.Fan Y*, Shen S*, Wei G*, Tang J*, Zhao Y, Wang F, He X, Guo G, Shang X, Yu X, Ma Z, He X, Liu M, Zhu Q, Le Z, Wei G, Cao J, Jiang C^#, Zhang Q^#. (2020) Rrp6 Regulates Heterochromatic Gene Silencing via ncRNA RUF6 Decay in Malaria Parasites. mBio, 2020, 11(3): e01110-20

说明：本研究发现RRP6通过降解新生非编码RNA-Ruf6，维持基因组特定区域异染色质状态与高级结构，控制该区域致病基因有序表达，从而实现在人体内免疫逃逸的新机制。

6.沈仕君。原始生殖细胞的命运决定。2021年《科学1915》