蛋白质的翻译后修饰（PTM），如磷酸化、乙酰化等，是调控蛋白质功能、影响癌症等疾病发生发展的关键机制，也是决定药物疗效和产生耐药性的核心因素。尽管大量研究揭示了单个PTM事件如何影响特定药物的作用，但这些信息散在于海量文献中，缺乏系统性整理。现有数据库多侧重于PTM本身或PTM-疾病二元关系，而能够明确揭示“在何种疾病中，何种PTM如何影响哪种药物疗效”的三元关联资源一直缺失，这严重制约了科研人员从PTM角度系统理解药物响应机制、发现新药靶和预测性生物标志物的能力。

2025年9月21日，同济大学生命科学与技术学院王海芸教授团队在《Nucleic Acids Research》在线发表了题为“PMADS: an integrated database of curated and proteomics-inferred associations between protein post-translational modifications and drug sensitivity”的研究论文。该研究构建了目前首个系统整合PTM-药物-疾病三元关联的数据库PMADS，涵盖超过4700条人工整理和超过43800条基于蛋白质组学预测的关联数据，涉及6000余种蛋白质、1000余种药物、19类PTM修饰和300余种疾病类型。

PMADS通过大规模文献挖掘与蛋白质组学数据分析，提供了结构化的PTM中心化药物响应机制注释，支持用户从上游调控机制（如药物诱导PTM变化）到下游效应（如PTM介导的药物敏感性变化）的多维度查询。该数据库还提供三元关系图、置信度评分、外部数据库链接等功能，为肿瘤靶点发现、药物重定位及生物标志物识别提供重要数据基础。PMADS数据库已通过网站（https://pmads-db.org）免费开放。

同济大学生命科学与技术学院博士研究生郑杰为该项工作的主要完成人，王海芸教授为通讯作者。该研究工作由国家自然科学基金等项目资助。

原文链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1033