姓名：余招伟

学位：博士

导师情况：博士生导师

研究领域：生物信息学、人工智能生物学

E-mail：zhaoweiyu@tongji.edu.cn

通讯地址：上海市四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院（200092）

实验室主页：https://zhanglab.tongji.edu.cn

个人简介：

余招伟，博士生导师，同济大学生命科学与技术学院副教授。研究方向为基于生物信息学与人工智能生物学方法，解析细胞命运决定的分子机制并进行合成设计。近年来发展了一系列生物信息学算法，揭示了细胞命运决定过程中转录调控的复杂网络机制。相关论文以第一作者（含共同）身份发表在Nature Cell Biology、Molecular Cell、Nature Communications、Genome Biology等期刊上，担任Nature Communications等期刊审稿人。主持多个国家级和省部级科研项目，包括国自然青年基金、博士后科学基金面上项目、光合基金AI for Science专项课题，参与国自然基础科学中心项目、国自然重点项目、上海市计算生物学专项等。获得博新计划、上海市超级博士后等荣誉。担任Genome与AI：一作面对面在线学术论坛青年组委会委员。

代表文章：  

1. Yu Z^#, Yang D^#, Chen Q^#, Zhang Y^#, Li Z, Wang Y, Wang C, Zhang Y^*. Learning interpretable representation for context-specific transcription regulatory networks using a foundation model. bioRxiv 2025.

2. Yu Z^#, Wang Q^#, Zhang Q^#, Tian Y, Yan G, Zhu J, Zhu G^*, Zhang Y^*. Decoding the genomic landscape of chromatin-associated biomolecular condensates. Nat Commun 2024; 15:6952.

3. Yu Z, Zhang Y^*. Foundation model for comprehensive transcriptional regulation analysis. Natl Sci Rev 2024; 11:nwae355.

4. Huo D^#, Yu Z^#, Li R, Gong M, Sidoli S, Lu X, Hou Y, Dai Z, Kong Y, Liu G, Jensen O, Xie W, Helin K, Xiong C, Li G, Zhang Y^*, Wu X^*. CpG island reconfiguration for the establishment and synchronization of polycomb functions upon exit from naive pluripotency. Mol Cell 2022; 82(6):1169-85.

5. Yang H^#, Bai D^#, Li Y^#, Yu Z^#, Wang C, Sheng Y, Liu W^*, Gao S^*, Zhang Y^*. Allele-specific H3K9me3 and DNA methylation co-marked CpG-rich regions serve as potential imprinting control regions in pre-implantation embryo. Nat Cell Biol 2022; 24:783-92.

6. Hu S^#, Huo D^#, Yu Z^#, Chen Y^#, Liu J, Liu L, Wu X*, Zhang Y*. ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non-classical functions of histone modification regulators. Genome Biol 2020; 21: 48.