科研进展

同济大学曹志伟教授团队与上海市公共卫生临床中心合作在 Journal of Genetics and Genomics在线发表关于武汉新型冠状病毒2019-nCoV抗原性计算的文章

发布时间:2020-01-31  

新冠状病毒与SARS存在交叉保护表位,有望推动中和阻断抗体研发


同济大学曹志伟教授团队与上海市公共卫生临床中心合作,关于武汉新型冠状病毒2019-nCoV抗原性计算的文章(Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus),2020130日在 Journal of Genetics and Genomics在线发表。全文 链接如下:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852720300138

201912月以来,武汉新型冠状病毒感染引起的肺炎传播迅速,疫情紧急,研发中和保护性抗体迫在眉睫。然而抗体研发所需的关键信息-中和保护表位,尚未被揭示。

据报道,S蛋白是冠状病毒与宿主细胞表面ACE2受体结合、进而介导病毒进入宿主细胞的关键表面蛋白,是疫苗抗体研发的重要靶点。基于具有自主知识产权的免疫原性计算工具CE-Blast,研究小组对所有冠状病毒的S蛋白进行了系统性的结构模拟和免疫原性扫描,计算了新病毒与已知17种冠状病毒亚型之间的免疫原性距离,发现新病毒S蛋白的免疫原性总体上与SARS更为接近。进一步计算揭示,2019武汉新冠状病毒与SARS冠状病毒的S抗原在受体接合区域(RBD)上存在潜在交叉反应表位。

最为重要的是,其中一处与人ACE2受体结合位点紧密毗邻。因此,针对该表位区域研发抗体,空间位阻效应可能阻断病毒与ACE2受体的结合,有望起到病毒感染保护作用。同时,针对该表位区域的SARS抗体,可能对2019新病毒具有潜在临床治疗价值。

本研究特色在于采用专有免疫计算技术进行大规模扫描,可在突发/新发传染病早期,为抗体/疫苗研发提供理论提示与快速引导。同济大学生命科学与技术学院曹志伟教授与上海公共卫生中心徐建青教授为本文共同通讯作者,公共卫生中心裘天颐博士和同济大学博士生毛甜甜为共同第一作者。


为加快新病毒抗体与疫苗研发,同济大学曹志伟团队现向研发机构免费共享抗体研发相关的计算预测技术,以下为在线计算网址:

  1. 抗原空间表位预测工具最新版本SEPPA3.0 Nucleic Acids Research, 2019):

http://www.badd-cao.net/seppa3/index.html

http://bidd2.nus.edu.sg/SEPPA3/


  1. 空间表位免疫相似性搜索 CE-BlastNature Communications, 2018):http://bidd2.nus.edu.sg/czw/ce_blast/



1: 2019-nCoV S蛋白免疫原性分析:与SARS存交叉保护表位,具中和保护潜能


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