姓名：余贤斌

学位：博士

导师情况：博士生导师

研究领域：生物信息学与RNA修饰

E-mail:   xbyu@tongji.edu.cn

通讯地址：上海市杨浦区四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院，邮编200092

研究方向：

  利用多组学数据整合分析，探索非编码RNA及其化学修饰对染色质重塑和基因转录活性调控的分子机制，并关注这些调控机制在干细胞分化和胚胎早期发育中的作用机制。

  目前主要研究方向包括：

1. RNA m6A 去甲基化酶对干细胞分化和胚胎发育的特异性调控

2. 非编码RNA修饰与染色质的互作及其对胚胎发育的调控

3. 多组学数据挖掘揭示胚胎早期发育的分子调控机制。

个人简介：

  2008年毕业于浙江大学生命科学学院。2015年毕业于中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所，获得理学博士学位。2019-2024年于芝加哥大学何川教授实验室从事博士后研究。2024年8月起任同济大学生命科学与技术学院特聘研究员。

代表性论文：

1. Wang L*, Si W*, Yu X*, Piffko A, Dou X, Ding X, Bugno J, Yang K, Wen C, Zhang L, Chen D, Huang X, Wang J, Arina A, Pitroda S, Chmura SJ, He C, Liang HL, Weichselbaum R. Epitranscriptional regulation of TGF-β pseudoreceptor BAMBI by m6A/YTHDF2 drives extrinsic radioresistance. J Clin Invest. 2023 Dec 15;133(24):e172919. doi: 10.1172/JCI172919.

2. Wei J*, Yu X*, Yang L*, Liu X*, Gao B, Huang B, Dou X, Liu J, Zou Z, Cui XL, Zhang LS, Zhao X, Liu Q, He PC, Sepich-Poore C, Zhong N, Liu W, Li Y, Kou X, Zhao Y, Wu Y, Cheng X, Chen C, An Y, Dong X, Wang H, Shu Q, Hao Z, Duan T, He YY, Li X, Gao S, Gao Y, He C. FTO mediates LINE1 m6A demethylation and chromatin regulation in mESCs and mouse development. Science. 2022 May 27;376(6596):968-973.

3. Dou X*, Xiao Y*, Shen C*, Wang K*, Wu T, Liu C, Li Y, Yu X, Liu J, Dai Q, Pajdzik K, Ye C, Ge R, Gao B, Yu J, Sun S, Chen M^#, Chen J^#, He C^#. RBFOX2 recognizes N⁶-methyladenosine to suppress transcription and block myeloid differentiation. Nat. Cell Biol 2023 https://doi.org/10.1038/s41556-023-01213-w.

4. Wang L*, Dou X*, Chen S*, Yu X, Huang X, Zhang L, Chen Y, Wang J, Yang K, Bugno J, Pitroda S, Ding X, Piffko A, Si W, Chen C, Jiang H, Zhou B, Chmura S, Luo C, Liang H, He C, Weichselbaum R. YTHDF2 inhibition potentiates radiotherapy antitumor efficacy. Cancer Cell. 2023. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2023.04.01.

5. Dou X*, Huang L*, Xiao Y*, Liu C, Zhang X, Yu L, Li Y, Zhao R, Yang L, Chen C, Yu X, Gao B, Qi M, Gao Y, Shen B, Sun S, He C, Liu J. METTL14 is a chromatin regulator independent of its RNA N⁶-methyladenosine methyltransferase activity. Protein Cell, 2023;pwad009.

6. He PC*, Wei J*, Dou X*, Harada BT*, Zhang Z, Ge R, Liu C, Zhang LS, Yu X, Wang S, Lyu R, Zou Z, Chen M, He C. Exon architecture controls mRNA m⁶A suppression and gene expression. Science. 2023 Feb 17;379(6633):677-682.

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