重点研发计划与973首席

尹晓磊

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发布时间:2025-03-22  

姓    名:尹晓磊

学    位:博士

导师情况:博士生导师

研究领域:干细胞命运调控与再生医学;类器官构建与转化应用

 

E-mail:  xyin@tongji.edu.cn

 

通讯地址:上海市四平路1239号


教育与工作经历:

  • 北京大学生命科学学院,本科、博士;

  • MIT Koch Institute,博士后

  • Harvard Medical School / Brigham and Women’s Hospital,Instructor & Associate Bioengineer

  • 同济大学生命科学与技术学院,教授2018年至今)

                       

个人简介:

尹晓磊,同济大学生命科学与技术学院教授、博士生导师,同济大学附属东方医院再生医学研究所研究员。入选国家高层次人才青年项目,科技部国家重点研发计划项目负责人。本科及博士毕业于北京大学生命科学学院,博士期间师从邓宏魁教授从事干细胞研究。此后于MIT Koch Institute完成博士后训练Robert Langer实验室),并任哈佛大学医学院Brigham and Women’s Hospital讲师及生物工程师2018年全职回国,加入同济大学

长期从事成体干细胞命运调控的机制与方法研究,以及干细胞和类器官技术的临床与产业转化。以第一或通讯作者在Cell Stem CellNature MethodsNature Communications等期刊发表论文,累计被引用6200余次。作为负责人主持科技部国家重点研发计划干细胞及转化研究重点专项、国家自然科学基金委面上项目、上海市科委重大项目等多个课题。

 

研究内容:      

成体干细胞广泛存在于人体多种组织器官中,通过自我更新维持自身数量,通过分化产生功能性细胞来维护组织稳态和修复损伤。实验室围绕干细胞命运调控开展系统性研究,关注的核心问题是:干细胞的自我更新与分化由哪些信号通路协同调控?如何利用这些知识主动操控细胞命运?

在研究策略上,实验室不仅在机制层面解析干细胞命运决定的信号逻辑,更通过小分子化合物等化学手段将机制认知转化为实际的调控能力——精确控制干细胞的扩增与分化方向,构建功能可调的类器官培养体系,服务于功能性细胞的体外获取、疾病建模、药物筛选,以及体内组织损伤的原位修复。当前主要研究领域包括:

感觉系统再生 哺乳动物内耳毛细胞损伤后无法自发再生,是感音神经性耳聋缺乏根治手段的根本原因。实验室利用干细胞和类器官技术高效生成功能性毛细胞,并将类似策略拓展到其他感觉系统的再生研究。

消化系统与类器官 肠道上皮每3-5天整体更新一次,是研究干细胞自我更新与分化平衡的理想体系。实验室建立了可调控的肠道类器官培养平台,实现了干细胞维持与功能性分化的动态控制,用于疾病建模、药物筛选和再生医学研究。

上述研究策略在原理上具有广泛的可拓展性,在视觉再生、毛发再生、脊髓神经修复、心肌再生等领域同样具有潜在的应用前景。


代表性工作:

  • 发现p53iPS诱导中的关键抑制作用,鉴定出可将诱导效率提升百倍以上的因子组合Cell Stem Cell 2008共同一作;机制后续5Nature文章进一步验证)

  • 发展了工程化调控成体干细胞与类器官行为的方法学平台Nature Methods 2014,ESI高被引)

  • 受邀在Cell Stem Cell发表关于工程学方法调控干细胞行为的综述(2016封面文章ESI高被引,入选Best of 2016

  • 建立了可调控的人小肠类器官培养体系,通过微环境信号调控实现干细胞自我更新与分化的动态平衡,为类器官在药物筛选和疾病建模中的应用提供了新途径(Nature Communications 2025

  • 从哺乳动物耳蜗中实现了Lgr5+干细胞的克隆扩增和高纯度感觉毛细胞生成(Cell Reports 2017,封面,共同一作),相关技术推动了听力再生领域的产业转化探索;近期进一步建立了优化的内耳类器官体系,用于毛细胞再生和耳毒性响应研究Sci China Life Sci 2025-2026)


累计被引用6200余次。代表性论文如下:

1. C. Li, D. He, W. Tang, L. Fu, X. Tan, Y. Yao, X. Yin*. Synergistic SHH activation and BMP inhibition remodel progenitor niche for enhanced hair cell generation. Sci China Life Sci. 2026.

2. L. Yang#, X. Wang#, X. Zhou, H. Chen, S. Song, L. Deng, X. Yin*. A tunable human intestinal organoid system achieves controlled balance between self-renewal and differentiation. Nat Commun. 2025.

3. X. Qin#, L. Fu#, C. Li, X. Tan, X. Yin*. Optimized inner ear organoids for efficient hair cell generation and ototoxicity response modeling. Sci China Life Sci. 2025.

4. X. Zhou, L. Yang, S. Song, X. Yin*. A modified system to promote stemness of mouse intestinal stem cells by activating Nrf2 and α2-adrenergic receptor signaling pathway. Acta Biochim Biophys Sin. 2025. 封面文章

5. Y. Liao, Z. Lin, S. Li, X. Yin*. Small molecules enhance the high-efficiency generation of pancreatic ductal organoids. Acta Biochim Biophys Sin. 2024.

6. L. Yang, X. Wang, G. Zhao, L. Deng, X. Yin*. Leveraging temporal Wnt signal for efficient differentiation of intestinal stem cells in an organoid model. Stem Cells Dev. 2024. 封面文章

7. W. McLean#, X. Yin#, L. Lu, D. Lenz, D. McLean, R. Langer#, J.M. Karp#, A. Edge#. Clonal expansion of Lgr5-positive cells from mammalian cochlea and high-purity generation of sensory hair cells. Cell Rep. 2017. 封面文章

8. X. Yin, B. Mead, H. Safaee, R. Langer, J.M. Karp, O. Levy. Engineering stem cell organoids. Cell Stem Cell. 2016. 封面文章. “Best of 2016”. ESI高被引论文

9. X. Yin*, J.M. Karp*. Stomaching Notch. EMBO J. 2015.

10. X. Yin, H.F. Farin, J.H. van Es, H. Clevers, R. Langer, J.M. Karp. Niche-independent high-purity cultures of Lgr5+ intestinal stem cells and their progeny. Nat Methods. 2014. ESI高被引论文

11. Y. Zhao#, X. Yin#, H. Qin#, F. Zhu, H. Liu, W. Yang, Q. Zhang, C. Xiang, et al. Two supporting factors greatly improve the efficiency of human iPSC generation. Cell Stem Cell. 2008. ESI高被引论文

 

代表性专利:

 PCT/CN2025/141935 人小肠类器官培养相关专利(申请中)

• PCT/US2015/048442 Compositions, systems, and methods for generating inner ear hair cells for treatment of hearing loss.已获美国、中国、日本、澳大利亚、欧洲等授权

• PCT/US2014/023197 Compositions and methods for epithelial stem cell expansion and culture. 已获美国、澳大利亚、日本等授权

欢迎具有生物学、医学、化学、工程学等背景的同学加入实验室,共同探索干细胞与再生医学的前沿问题。

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