教授

余 勇

发布时间:2019-05-08  

姓       名:余勇

学      位: 博士

导师情况:博士生导师

研究领域:天然淋巴细胞、过敏性炎症、单细胞测序

                 肿瘤免疫、T细胞再生、CRISPR/Cas9

                 造血干细胞、血液学、免疫缺陷小鼠

电子邮箱:yy3@tongji.edu.cn

办公室电话:021-65984541

通讯地址:上海市赤峰路67号实训楼504室


本课题组常年招聘助理教授,博士后和研究助理,待遇从优。欢迎对干细胞和免疫细胞相关基础与转化研究感兴趣的广大博士生,硕士生,本科生报考和实习。2020年预计招收3名博士后,2名博士研究生,2名硕士研究生及2名本科实习生。


教育及工作经历:

2019.04-至今,  同济大学,生命科学与技术学院,教授    

                         细胞干性与命运编辑前沿科学中心,研究员

2018.02-至今,  同济大学,上海市第一妇婴保健院,研究员

2017.09-2019.04,同济大学,生命科学与技术学院,特聘研究员

2013.02-2017.12,英国剑桥大学Sanger研究所,博士后

2006.09-2012.12,华中农业大学-剑桥大学,联合培养博士


个人简介:

       2010年至2012年余勇在英国剑桥大学Sanger研究所完成博士课题,期间鉴定了调控B细胞发育和造血干细胞维持的关键转录因子Bcl11a。2013年至2017年余勇在英国剑桥大学Sanger研究所从事干细胞与淋巴细胞发育博士后研究工作,首次在单细胞水平解析了ILC2细胞发育途径及其关键调控因子Bcl11b,首次发现ILC2细胞功能受PD-1通路调控。

      2017年9月起正式受聘于同济大学生命科学与技术学院,先后入选同济大学“青年百人(A岗)计划”、上海市“浦江人才计划”、上海高校特聘教授(东方学者)岗位计划。


研究方向:

      实验室主要以基因修饰小鼠和临床样本为对象,运用单细胞RNA测序、基因编辑、CRISPR/Cas9筛选等分子、生化和细胞生物学手段,揭示干细胞与淋巴细胞发育、分化的调控机制,以期为炎症性疾病、肿瘤的治疗提供新思路。具体研究方向如下:

1. ILC2细胞的发育及其功能调控机制研究

       Ⅱ型天然淋巴细胞(Group 2 innate lymphoid cells,ILC2s)是近年来新发现的一类淋巴样固有免疫细胞,广泛分布于黏膜组织中,在组织稳态调节、神经系统免疫调控、脂肪组织代谢调控、病原菌感染、炎症性疾病、自身免疫病和肿瘤中起重要作用,揭示ILC2的发育机制与功能调控机理不仅具有重要理论价值,还具有重大的临床意义。我们围绕肺部炎症相关疾病开展ILC2发育途径和活化调控机制的研究,利用基因报告小鼠模型、条件性基因敲除小鼠模型、炎症性疾病模型、细胞过寄性转移、细胞体外培养、多色流式分析、单细胞RNA测序等技术手段,系统揭示ILC2细胞的致病机理,筛选治疗肺部炎症的新靶点,为临床药物的开发提供理论指导。

                                图1 PD-1抗体可以消除由ILC2细胞诱发的气道炎症(Yu Y et al., Nature, 2016)


2. CRISPR/Cas9高通量筛选肿瘤免疫治疗新靶点

        针对PD-1、CTLA4等免疫检查点的单克隆抗体在部分肿瘤病人中取得了显著疗效,但对大部分患者无效。我们运用CRISPR/Cas9系统结合T细胞体外、体内杀伤实验筛选调控T细胞杀伤性能的关键因子并揭示相应的分子调控机制。

                         图2 细胞毒性T细胞攻击肿瘤细胞示意图(Adopted from《How It works》杂志,2015)


3. T细胞再生及其机制研究

       T淋巴细胞是肿瘤的最有效杀手,T细胞过继治疗已在临床上发挥显著疗效,结合重编程技术再生T细胞具有直接应用价值。我们采用重编程、基因编辑、高通量筛选、单细胞测序、基因敲除小鼠模型、人源化小鼠模型系统开展T细胞体外再生及其调控机制研究。

                                                                    图3 T细胞体外再生示意图




发表文章:

  1.  Yu Y#,Tsang JC#, Wang C#, Clare S, Wang J, Chen X, Brandt C, Kane L, et al. (2016) Single-cell RNA-seq identifies a PD-1(hi) ILC progenitor and defines its development pathway. Nature,539(7627): 102-106. (IF=41.577, 被引53次, F1000 推荐)

  2.  Yu Y#,Wang C, Clare S, Wang J, Lee SC, Brandt C, Burke S, Lu L, et al. (2015) The transcription factor Bcl11b is specifically expressed in group 2 innate lymphoid cells and is essential for their development. J Exp Med, 212(06): 865-874. (IF=10.79, 被引64次)

  3.  Yu Y#,Wang J#, Khaled W#, Burke S, Li P, Chen X, Yang W, Jenkins NA, et al. (2012) Bcl11a is essential for lymphoid development and negatively regulates p53. J Exp Med, 209(13): 2467-2483. (IF=10.79, 被引73次)

  4.  Yu Y#*, Liu P*. (2019) Usage of Single-Cell RNA Sequencing to Unveil Immune Lymphoid Cell Precursors. Methods Mol Biol, 1884:73-86.(专著章节, 共同通讯)

  5.  Tsang JC#, Yu Y#, Burke S, Buettner F, Wang C, Kolodziejczyk AA, Teichmann SA, Lu L, and Liu P. (2015) Single-cell transcriptomic reconstruction reveals cell cycle and multi-lineage differentiation defects in Bcl11a-deficient hematopoietic stem cells. Genome Biol, 16, 178. (IF=13.214, 被引42次)

  6.  Ellis PJ#, Yu Y#,and Zhang S. (2011) Transcriptional dynamics of the sex chromosomes and the search for offspring sex-specific antigens in sperm. Reproduction, 142(5): 609-619.(IF=3.086,被引8次)

  7.  Yang J#, Ryan DJ. #, Wang W#, Tsang JC#, Lan G#, Masaki H#, Gao X, Antunes L, Yu Y, Zhu Z, Wang J, …, Liu P*. Establishment of Mouse Expanded Potential Stem Cells, Nature, 2017, 550 (7676): 393-397.

  8.  Khaled WT#, Lee SC#, Stingl J, Chen X, Ali HR, Rueda OM, Hadi F, Wang J, YuY, Chin S, Stratton M, Futrea A, Jenkins NA, Aparicio S, Copeland NG, Watson CJ, Caldas C, Liu P*. BCL11A is triple-negative breast cancer gene with critical functions in stem and progenitor cells. Nature communication, 2015, 15(6): 5981.  

  9.  Walker JA#*, Oliphant CJ, Englezakis A, Yu Y, Clare S, Rodewald HR, Belz G, Liu P, Fallon PG, McKenzie ANJ*. Bcl11b is essential for group 2 innate lymphoid cell development. J Exp Med, 2015, 212(6): 875-882.

  10.  Zhang W#*, Chronis C, Chen X, Zhang H, Spalinskas R, Pardo M, Chen L, Wu G, Zhu Z, Yu Y, Yu L, Choudhary J, Nichols J, Parast MM, Greber B, Sahlén P, Plath K. The BAF and PRC2 Complex Subunits Dpf2 and Eed Antagonistically Converge on Tbx3 to Control ESC Differentiation. Cell Stem Cell, 2019, 24(1):138-152.e8.


        


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