教授

张晓艳

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发布时间:2019-05-08  

 

姓名:张晓艳
学位:博士
职称:教授
导师情况:博士生导师
研究领域:生物信息学
研究方向:
1、生物医学信息学
2、分子进化
电子邮件:xyzhang@tongji.edu.cn
通讯地址:上海市四平路1239号,同济大学生命科学与技术学院(200092)

个人简介:
2006-现在          同济大学生命科学与技术学院
2000-2003         复旦大学生命科学学院植物学专业博士生,2003年6月获理学博士学位
1998-1999         美国密执安州立大学博士生
1995-1997         美国新墨西哥州高地大学生命科学学院硕士生,1997年12月获科学硕士学位
1984-2000         中国科学院武汉植物研究所


代表性论文(#一作,*通讯):
1.Yang, X., Li, M., Liu, Q., Zhang, Y., Qian, J., Wan, X., Wang, A., Zhang, H., Zhu, C., Lu, X., Mao, Y., Sang, X., Zhao, H.*, Zhao, Y.* and Zhang, X.* 2015, Dr. VIS v2.0: an updated database of human disease-related viral integration sites in the era of high-throughput deep sequencing. Nucleic Acids Res. 43, D887–D892. (SCI 通讯作者)
2.Yuan, W., Huang, T., Yu, J., Zeng, L., Lian, B., He, Q., Li, Y., Zhang, X.*, Zhou, F.*, and Xie, L*. 2014, Comparative analysis of viral protein interaction networks in Hepatitis B virus and Hepatitis C virus infected HCC. Biochim. Biophys. Acta 1844, 271–279. (SCI 通讯作者)
3.Xin Zhao, Qi Liu, Qingqing Cai, Yanyun Li, Congjian Xu, Yixue Li, Zuofeng Li,*and Xiaoyan Zhang,* Dr.VIS: a database of human disease-related viral integration sites, Nucl. Acids Res. (2011) Nucleic Acids Research, 2012, Vol. 40, Database issue D1041–D1046(SCI 通讯作者)
4.Wang C, Zhang J, Cai M, Zhu Z, Gu W, Yu Y, Zhang X. (2015) DBGC: A Database of Human Gastric Cancer. PLoS ONE 10(11): e0142591. doi:10.1371/journal.pone.0142591(SCI 通讯作者)
5.Zuofeng Li, Xingnan Liu, Jingran Wen,Y, e Xu, Xin Zhao, Xuan Li, Lei Liu*, and Xiaoyan Zhang,* DRUMS: A human disease related unique gene mutation search engine, 2011, HUMAN MUTATION Database in Brief 32: E2259-E2265 (2011) Online (SCI 通讯作者)
6.Yang Yang, Zuofeng Li, Peng Nan, Xiaoyan Zhang*,2011,Drug-induced glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency-related hemolysis risk assessment, Computational Biology and Chemistry 35 (2011) 189–192 (SCI 通讯作者)
7. Liu Xinyi, Li Zuofeng,Cai Qingqing,Zhang Xiaoyan*. Prediction of multiple drug resistance phenotype in cancer cell lines using gene expression profiles and phylogenetic trees. Chinese Sci Bull, 2010, 55: 3778−3786 (SCI 通讯作者)
8.Xin Zhao, Zoufeng Li, Xiaoyan Zhang*. 2010. G6PD-MutDB: A MUTATION AND PHENOTYPE DATABASE OF GLUCOSE-6-PHOSPHATE (G6PD) DEFICIENCY. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. Volume: 8, Supplementary Issue 1(2010) pp. 101-1099(SCI 通讯作者)
9.张晓艳,生物信息学本科学位课程发展思考,中国大学教学,2018(3)37-39 (教育类核心期刊)


近期承担的主要项目:
1.2015-2019     基于HBV病毒感染人群HCC大规模医疗文本信息抽提与时间序列分析方法研究     国家自然科学基金,主持
2.2012-2014     建立疾病相关基因突变信息分析平台,上海市卫生局科研项目,主持
3.2012-2015     病毒整合位点模式特征识别,上海市自然科学基金,主持。
4.2010-2013     上海市高校示范性全英语教学课程建设,主持

专著/专利:
1.遗传性大肠癌家系数据库系统v1.0   2009SR035424
2.胃癌知识库软件V1.0                       2015SR199896

获奖情况:
1.2013获上海高校示范性全英语课程荣誉称号
2.2015年同济大学三八红旗手
3.2016 同济大学育才教育奖教金

 

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