范国平教授与祝献民副研究员在《Scientific Reports》发表论文,在单细胞水平上揭示了外周神经损伤修复过程中的转录机制.
2016年8月25日,同济大学生命科学与技术学院范国平教授与祝献民副研究员在《Scientific Reports》杂志在线发表题为“Single-cell RNA-seq reveals distinct injury responses in different types of DRG sensory neurons”的研究论文。
外周神经损伤后,胞内外的所有信号汇总到神经元,引起整个基因组在转录和翻译水平的变化,最终导致神经再生、生理疼痛以及细胞死亡等各种应激反应。由于实验技术限制,以往的研究以大量细胞为研究对象,无法在单细胞水平解释外周神经损伤修复的机制。在该研究中,胡甘露等研究人员首次对小鼠坐骨神经横断(SNT)后3天的非肽能感受器(NP)、肽能感受器(PEP)和大的有髓神经元(LM)等三类神经元进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),然后对转录组进行了主成分分析(PCA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)。该研究根据转录组对损伤的不同应答可以将背根神经节(DRG)神经元分为不同的亚型,而且发现了新的损伤应答基因,其中包括与神经发育、蛋白质翻译和胞质运输等密切关联的再生相关基因(RAG)。此外,研究人员还在一类NP神经元中发现了显著上调的PDCD2等细胞凋亡基因,证明这些基因与神经损伤后的细胞死亡密切相关。综上所述,该研究在单细胞水平上揭示了外周神经损伤具有异质性的转录应答机制,同时表明不同的基因调控网络在不同亚型的神经元中参与了神经再生、细胞死亡和神经痛等复杂的生物过程。
同济大学生命科学与技术学院的范国平教授和祝献民副研究员为本文的通讯作者。博士生胡甘露为本文的第一作者。本项目得到了国家自然科学基金委、科技部重大科学研究计划、上海市科委和国家留学基金管理委员会的资助。
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